مردانی که حامل ویروس پاپیلومای انسانی اچ پی وی میباشند در معرض خطر بالاتر ابتلا به عفونت اچ آی وی نیز میباشند
این الگو درطی انجام آزمایشاتی در هر دو مردان ختنه شده و ختنه نشده یکسان بود. با مطالعات مشاهده ای، در حال حاضرهنوز معلوم نیست که آیا نقش واکسن اچ پی وی به کاهش خطر ابتلا به کسب ویروس اچ آی وی وجود دارد یا نه
با این حال واکسن اچ پی وی نشان داده شده است که برای جلوگیری از سرطان اچ پی وی درارتباط است. مجموعه ای از آزمایش های بالینی تصادفی در کیسومو درغرب آفریقا بین سال های 2002 و2007 انجام شده است که در این آزمایشات نمونه هایی از آلت تناسلی، پوست ختنه گاه، سرآلت گرفته شده بود. این مطالعه نشان داد که فقط نمونه های از سر آلت با افزایش خطر ابتلا به اچ آی وی همراه بوده. در واقع هدف از این مطالعه بررسی اثر ختنه در کاهش ابتلا به عفونت اچ آی وی بوده است
در مجموع 61 نفر از مردان مبتلا به عفونت اچ پی وی به عفونت اچ آی وی نیز مبتلا بوده اند<